Web程序简化了人工基因设计


Will Knight美国微生物学家发布了一个基于网络的程序,简化了设计人工DNA所涉及的许多棘手步骤这个名为GeneDesign的软件套件应该让研究人员更容易修改和研究DNA基因合成的成本正在迅速下降,全世界有数十家公司现在提供从DNA的化学成分中订购基因 GeneDesign由美国巴尔的摩约翰霍普金斯大学医学院的Jef Boeke领导的研究人员创建它简化并自动化DNA设计的几个关键步骤这些关键步骤包括将蛋白质和氨基酸 - 构成蛋白质的构建块 - 转化为DNA序列或者软件可以操纵模拟DNA“密码子”,它可以编码氨基酸 DNA密码子由三个核苷酸组成 - 连接在一起形成DNA链的基本分子或软件可用于识别DNA限制位点 - 可拼接或切割的DNA片段,以便混合合成和天然脱氧核糖核酸 “订购任何你想要的DNA的能力是赋予权力,设计过程本身非常有趣,并提供了一个全新的视角,”Boeke告诉新科学家 “这是一个非常好的工具,”美国麻省理工学院生物工程师Drew Endy说 “但你应该期待它在18个月内过时”Endy说,越来越先进的基因设计软件的开发反映了基因可以定制的技术难易程度 “我们正处于这个有趣的阶段,它很容易合成DNA,”恩迪说 “拥有软件环境来支持这一点非常重要”但这也是一个值得关注的问题 New Scientist于2005年11月进行的一项调查显示,很少有基因合成公司检查他们被要求制造的基因是安全的,或者在收到订单后进行客户背景调查 “任何强大的新技术都可能导致误用,”Boeke说 “合成生物学界自豪地设想了技术的黑暗面,并尽可能地建立保护措施,以最大限度地降低与基因合成技术相关的风险”面对这样的担忧,Boeke的团队希望引入安全措施来防范任何人使用他们的软件来设计可用作生物武器的基因然而,Boeke说,访问定期更新的可疑基因数据库至关重要他相信基因设计软件将变得越来越强大 “下一个规模将是整个染色体和基因组的合成,
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